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翌圣解决方案|“后疫情时代”不明原因肝炎、猴痘再掀波澜
人类的发展史也是人类与疾病斗争的历史,例如伤寒(伤寒杆菌)、天花(天花病毒)、麻疹(麻疹病毒)、鼠疫(鼠疫耶尔森菌)等都曾夺走无数人的生命,给人们带来的恐惧至今仍然挥之不去。即使进入21世纪,针对病原体的治疗与疫苗接种大大降低了感染性疾病的影响,但随着新发病原微生物的出现、耐药病原微生物的增多,感染的发病率和死亡率仍居高不下。2018年,据世界卫生组织( WHO) 统计数据显示,全球每年约有1500万人死于感染,约占全球每年总死亡率的25.5%。感染性疾病对全球公共卫生重大威胁。

如今历史可能又要重演。2019年底爆发的“新冠”疫情至今仍未平息,截止到2022年5月26日,全球累计感染患者超5.2亿,累计死亡人数超630万,并演变出Alpha、Beta、Gamma、Delta、Omicron等至少11个亚种,有愈演愈烈的态势。正值Omicron肆虐全球之际,不明原因儿童肝炎的报道又引起轩然大波,目前,已有20个国家报告了至少348例不明病因儿童肝炎疑似病例,造成至少5名儿童死亡。一波未平,一波又起,从5月7日英国首次通报发现猴痘疫情,截止到2022年5月24日,全世界范围内已报告猴痘病例131例,另有疑似猴痘病例106例,最近多个欧洲国家研究团队发布新一轮猴痘病毒基因测序报告显示,猴痘已经在欧洲发生了大规模的社区传播,这更是将世界紧张氛围推向冰点。


什么是不明原因儿童肝炎、猴痘?


不明原因儿童肝炎


临床表现:急性肝炎,大多出现呕吐和腹泻症状、眼睛和皮肤发黄、肝脏肿大,部分患者出现了上呼吸道症状。

发病病因:所有患者均排除甲、乙、丙、丁和戊型肝炎,但“罪魁祸首”是否是腺病毒(双链DNA),众多专家学者仍在激烈争论中,此外,腺病毒多达50多种。


猴痘


临床表现:发烧、头痛、嗜睡、虚弱乏力、淋巴结肿大、背部疼痛和肌肉疼痛等症状,发烧后的1至5天内,患者的面部开始出现大小不等的皮疹。虽然正痘病毒和“天花”病毒是近亲,但其人际传播效率、感染死亡率(3%-6%)均远低于天花。

发病病因:是一种人畜共患的正痘病毒(双链DNA病毒)感染所致。


mNGS助力精准锁定病原


不明原因儿童肝炎的“主要嫌疑犯”腺病毒41型有多达50多种亚种,还有其它可能共同引发肝炎的病原微生物仍未得到确认,目前主流厂商推出不明肝炎qPCR检测试剂盒主要针对41型腺病毒进行检测,即使是通用版本也只是检测12种腺病毒(1、2、3、4、6、7、11、14、15、55、40和41型),因此qPCR检测通量有限,加上病毒突变的可能,增加了漏检的风险。

同时,法国研究团队基于illumina平台测序发现,相较于2018年在英国发现的猴痘病毒基因,这四份猴痘病毒基因样本出现了46个单核苷酸多态性位点((SNPs)和3个缺失,提示猴痘病毒的核苷酸变异率显然超乎人的预期,全球更应该警惕和持续监控其突变菌株。

此外,猴痘、不明原因肝炎通常会诱发的患者并发症,如感染性的休克、呼吸衰竭、肝肾功能衰竭等,导致重症感染的患者的形成,这样一来致病病原高达数种甚至十几种(长期用药可能形成耐药病原菌),这要求一种技术能全面检测样本所有病原菌,即使是发生基因突变的病原菌也能检测到。毫无疑问mNGS完美契合这个需求。

回溯历史,这位沙场老将参与过2016年塞卡病毒鉴定,2019年,新冠疫情爆发后短短几天的时间,mNGS迅速确定这是新型冠状病毒,自此一战成名!后续更是持续助力新冠突变种Alpha、Beta、Gamma、Delta、Omicron溯源和动态监控,因此mNGS的可靠性和稳定性得到了实战验证。


DNA&RNA共建库:不明感染的克星


产品:


Hieff NGS® ds-cDNA Synthesis Kit(Cat#13488)
Hieff NGS® OnePot cDNA&gDNA Library Prep Kit(Cat#13502)

特点:


1)起始量兼容广:500pg-1μg RNA、DNA均能建库成功;
2)模块自由组合:Cat#13502可进行DNA建库,搭配Cat#13488可进行DNA&RNA共建库,模块灵活搭配,经济便捷;
3)极速实验时间:3 h内完成共建库。

实验流程

 
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图1.RNA&DNA共建库流程

性能展示


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建库性能


不同起始量标准品RNA、小牛gDNA进行建库测序,500pg-1μg RNA、DNA均能建库成功。

表1.DNA建库性能

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表2.RNA建库性能

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不明原因肝炎、猴痘病原快速检测,

翌圣IVD解决方案


目前不明原因肝炎、猴痘主流检测方案是qPCR。圣湘生物、达安基因、硕世、之江等多家上市公司宣布,已储备猴痘病毒核酸检测试剂盒。其中之江生物、凯普生物、达安基因等多家IVD企业的猴痘病毒试剂盒已获CE认证。针对qPCR检测方式,翌圣提供样本提取(直扩免提取)、检测预混液(含UDG全预混)以及可靠的检测原料(单酶、核苷酸),同时翌圣推出试剂、原料定制开发服务(IVD RDC),帮助客户快速上市分子诊断试剂盒。

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图2.翌圣IVD RDC可定制产品线


产品详情

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